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溴脲苷
[CAS 59-14-3]

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基本信息
产品分类生物化工 >> 核苷类药物 >> 脱氧核苷酸及其类似物
产品名称溴脲苷
英文名Broxuridine
别名5-Bromo-2'-deoxyuridine; 2'-Deoxy-5-bromouridine; BDU
分子结构溴脲苷分子结构 (CAS 59-14-3)
分子式C9H11BrN2O5
分子量307.10
CAS 登录号59-14-3
EC 号码200-415-9
分子行输入简码
SMILES
C1[C@@H]([C@H](O[C@H]1N2C=C(C(=O)NC2=O)Br)CO)O
物理化学性质
密度1.9±0.1 g/cm3 计算值*
熔点191 - 194 °C (分解) (实验值)
溶解度DMSO: 50 mg/mL, 水: 50 mM (实验值)
折射率1.652 (计算值)*
*使用计算机软件 Advanced Chemistry Development (ACD/Labs) Software.
安全数据
危险品标志symbol   GHS08 危险  说明
危害标签H340-H341-H361  说明
防护标签P203-P280-P318-P405-P501  说明
危害分类
up    说明
危害分类类别码危害标签
生殖毒性Repr.2H361
生殖细胞致突变性Muta.1BH340
生殖细胞致突变性Muta.2H341
致癌性Carc.2H351
生殖细胞致突变性Muta.1AH340
皮肤刺激Skin Irrit.2H315
眼刺激Eye Irrit.2H319
生殖毒性Repr.2H361fd
特定目标器官毒性—单次接触STOT SE3H335
生殖毒性Repr.1AH360
SDS化学品安全技术说明书参考文本
up chemBlink 化学品故事
溴脲苷在实验室更常称为溴脱氧尿苷(BrdU)。它与 DNA 组成原料胸苷相似,但碱基上的甲基被溴取代,糖仍是脱氧核糖。因此它是核苷,而不是单独的溴尿嘧啶,也不是带磷酸基的核苷酸。这些区别解释了为何加入细胞的物质与 DNA 合成时实际使用的形式并不相同。

细胞可把核苷转化成磷酸化衍生物,三磷酸形式可在 DNA 合成时替代通常由胸苷衍生的核苷酸。生成的 DNA 带有化学标记,表明标记物可用期间发生了掺入。溴属于碱基自身,不是能独立发光的染料。要看到类似物去了哪里,还须使用另一个检测手段。

Gratzner 在 1982 年报道了一种识别溴代及碘代脱氧尿苷标记的单克隆抗体。该方法帮助研究人员用抗体染色观察复制,并用流式细胞术定量。实验问题因而可以从“这一群细胞是否合成 DNA”转向“哪些细胞带有标记”。抗体识别也说明可接近性为何重要:掺在双链 DNA 内部的标记,不一定在与暴露单链相同的条件下可被抗体识别。

原始抗体可识别不止一种卤代类似物。这提醒我们,试剂名称不能完整描述选择性。如果两种标记用于区分不同时段的合成,同一抗体同时识别两者便不能判定信号来自哪个时段。选择标记时也须考虑检测化学。无标记对照可帮助区分来自掺入类似物的信号与样品或检测体系造成的背景。

后来的方法突显抗体识别的另一实际问题。2008 年,Salic 与 Mitchison 报道了使用乙炔基脱氧尿苷(EdU)的方法,其碱基取代基不同。他们通过与荧光试剂形成化学键检测掺入的类似物,而不是用抗体识别溴代碱基。比较指出,BrdU 检测通常需要破坏 DNA 双链以暴露标记。因此两种方法的区别不仅是掺入何种标记,也包括如何读取记录以及还能保留样品的哪些特征。

这段历史澄清了超出本类似物的一项区别:掺入、检测、解读是三个步骤。化合物可被细胞机制接纳,却不易检出;明亮的信号可以可靠检出,却可能对应不同于研究者想计数的过程。

阳性信号表示实验条件下发生 DNA 合成,并不自动代表细胞完成分裂。DNA 修复也可涉及合成,掺入标记的细胞未必都进入有丝分裂;观察时段外的细胞也可能随后分裂而未被记录。标记时机与生物背景都影响解读。掺入类似物本身也可影响细胞,因此标记并非化学上完全无干扰的观察者。溴脲苷说明,结构相似性可用来记录生物事件,独特的化学特征则可用来检出这份记录。

参考文献:
1. PubChem. 5-Bromo-2'-deoxyuridine, CID 6035. https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/6035
2. Gratzner HG. Monoclonal antibody to 5-bromo- and 5-iododeoxyuridine. Science (1982). https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7123245/
3. Salic A and Mitchison TJ. Chemical detection of DNA synthesis with EdU. PNAS (2008). https://doi.org/10.1073/pnas.0712168105

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